本发明涉及一种红外光谱图相似度确定方法及系统。方法包括:获取优化后不含背景的标准样品红外光谱图;获取待测样品红外谱图;根据待测样品红外谱图和标准样品红外谱图,确定比例因子;获取标准样品红外谱图向量的最小值和待测样品红外谱图向量的最小值;根据标准样品红外谱图向量的最小值和待测样品红外谱图向量的最小值,计算差分最小值;根据标准样品红外谱图向量、待测样品红外谱图向量、比例因子和差分最小值,计算标准样品红外谱图与待测样品红外谱图的绝对差;根据绝对差和待测样品红外谱图向量,计算待测样品红外谱图的绝对长度;根据绝对差和绝对长度,确定待测样品红外谱图与标准样品红外谱图的相似度。本发明能够快速、准确鉴别物质。