本发明提供了一种运输车辆车号与集装箱箱号关联系统,系统包括:装卸机,用于抓取集装箱,用第一摄像机拍摄得到集装箱图像;在获得确认装车指令后,将集装箱放至目标运输车辆,用第二摄像机拍摄得到目标运输车辆图像;图像识别子系统,用于识别集装箱图像得到箱号;若未获得箱号关联的源车号,向装卸机发送确认装车指令;识别目标运输车辆图像得到目标车号,用目标车号与箱号生成关联信息,向集装箱管理子系统发送关联信息;集装箱管理子系统,用于查找预设的箱号表,若查找到箱号关联的源车号,将源车号发送给图像识别子系统;按照关联信息,建立目标车号与箱号之间的关联关系。应用本发明实施例,提高了集装箱箱号与运输车辆车号关联的效率。