本发明公开一种高速公路桥隧之间短路基过渡段结构及其施工方法,本发明结构包括:隧道洞口高程以下连接结构、轻质混凝土、桥梁连接结构、加固小导管和短路基路面结构;加固小导管露头施作在隧道洞口高程以下连接结构内,加固小导管露头部分在隧道洞口高程以下连接结构和桥梁连接结构之间的短路基空隙间,混凝土回填在隧道洞口高程以下连接结构和桥梁连接结构间的短路基空隙间,短路基路面结构施作在轻质混凝土上;通过对过渡段的短路基、路面进行特殊处治,使基层间易于压实,路基沉降均匀,减少跳车隐患;同时将隧道中央排水沟延长从桥台下穿出,隧道洞口设胀缝同时取消桥台搭板,系统的解决短路基段的排水、路基沉降等问题。