本发明涉及一种含氟聚合物的制备方法,包括如下步骤:(1)向聚合反应器中加入去离子水,并将氧气含量降低至30ppm以下;(2)向所述反应器中加入自乳化单体A,再加入共聚单体B至反应器内压力为1.2~4.5Mpa,启动搅拌,控制反应器内温度为30~100℃,加入引发剂,开始聚合反应;(3)在保持所述压力和温度的条件下,加入剩余共聚单体B,反应至乳液中固含量为1~45%,结束反应。本发明避免使用对环保及人类健康不利的乳化剂,采用聚合单体自乳化的方式制备含氟聚合物,且所得到的含氟聚合物性能稳定,环境友好。